为了保证生产用菌种的纯净状态，接种菌种应在无杂菌的环境下进行，多数必须在专用接种室内进行，所以接种室在接种前要完全、彻底地灭菌。
生产中常用接种室一般包括套间二部分，接种室前应安装二重门。每周应用酒精、新洁尔灭或石碳酸对接种室消毒2~3次，同时还必须用蒸发皿盛少量的高锰酸钾粉末，放置于接种室地面中心，倒入少量的甲醛溶液，使甲醛熏蒸灭菌1-2次。对于条件较差的接种室，每次接种前都必须按上述方法进行消毒和灭菌。
接种室内的紫外线灯，每次接种前后，都必须开灯照射30—40分钟，使接种室在接种前能基本上呈为无菌状态。
每次接种前，操作人员必须在设立的专用洗澡室内，充分清洗身体，必要时可用适宜的消毒剂进行消毒，使全身保持清洁后，才可进入接种室内。
接种前，将原菌种、培养基等送入接种室的套间内，用70％的酒精擦抹试管、三角瓶等的外壁，注意不能弄湿棉塞，然后将注明菌名、编号、接种日期、接种人的标签贴于被接种的试管或三角瓶外壁上。贴标签的位置要考虑适中，以免接种时弄坏或掉落，造成编号混乱。
当以上工作准备完后，洗净双手、穿戴好预先在套间内用紫外线灯照射过的无菌工作服及工作帽，再用70％酒精消毒双手后，即携带菌种、培养基进入接种室内，用棉花沾70％酒精对试管、三角瓶外壁进行第二次消毒，并立即放在操作台的试管或三角瓶盛装架上。这时方可取出接种针准备接种。
